"十三五"后期,在政府政策综合导向下,高等院校依托附属医院建设高精尖研究院是适应时代新要求、谋求共同发展和实现跨越的创新之举。研究院学科建设直接关系到科学技术水平,也关乎着医院和大学核心竞争力的提升。文章以上海交通大学医学院分子医学研究院为例,在总结与分析研究院学科建设发展历程和建设成效的基础上,剖析其建设经验和主要成效,提出了新形势下研究院作为多个创新主体协同发展新模式,通过多学科交叉整合创新,推动临床医疗科技领域创新成果转化,得以增强自主创新能力和核心竞争力,全面推进学科可持续发展。